Lonkka- ja
kyynärdysplasiatutkimuksen tuloksia: periytymisasteet ja BLUP-indeksit
20.11.2000
Katariina Mäki
MMM, tutkija
Helsingin yliopisto, Kotieläintieteen
laitos/kotieläinten jalostustiede
Tänä syksynä
tutkimuksesta on meneillään osio, jossa lasketaan aineiston roduille lonkka- ja
kyynärdysplasian periytymisasteet. Tarkoituksena on myös määrittää jokaiselle
rodulle ns. indeksilaskentamalli ja tutkia, onko lonkkien ja kyynärnivelten
rakenteessa tapahtunut perinnöllisiä muutoksia viimeisten kymmenen vuoden
aikana.
Suomenajokoirille, kultaisillenoutajille ja rottweilereille lonkka- ja
kyynärdysplasian alustavat periytymisasteet on jo tässä vaiheessa laskettu ja
indeksilaskentamalli määritetty. Rottweilereillehan periytymisasteet laskettiin
ensimmäisen kerran jo vuonna 1998, mutta koska aineistoa oli kertynyt lisää yli
50%, kannatti periytymisasteet laskea uudestaan. Periytymisaste on
populaatiokohtainen ja voi hyvinkin muuttua kun aineistoa tulee lisää.
Ensimmäiset lonkka- ja kyynärdysplasian BLUP-indeksit on toimitettu rotujärjestöille, jotka ovat olleet mukana tutkimuksessa. BLUP-indeksi kuvaa koiran perinnöllistä tasoa ominaisuuden suhteen. Indeksejä laskettaessa ympäristötekijöiden häiritsevä vaikutus on poistettu koiran tuloksesta mahdollisimman hyvin, ja sukulaisten taso on otettu huomioon. Koiran indeksin ohella on syytä kiinnittää huomio sen tutkittujen jälkeläisten lukumäärään aineistossa, koska se antaa hyvää osviittaa indeksin varmuudesta. Jos koiralla ei ole omaa tulosta eikä yhtään tutkittua jälkeläistä, se on saanut indeksinsä pahimmassa tapauksessa vain vanhempiensa tulosten perusteella.Yleensä koiralla on myös sisarusten ja/tai puolisisarusten tuloksia, joten indeksi on useimmiten varmempi kuin pelkkä oma tulos. Kun tietoa jälkeläisistä tai muista sukulaisista kertyy, koiran indeksi muuttuu ja tulee varmemmaksi.
Indeksit laskettiin aineistosta, jossa oli kaikki tutkitut koirat vuodesta 1988 tämän vuoden toukokuuhun asti. Toukokuun 11. päivän jälkeen Kennelliiton lausunnon saaneet koirat eivät siis vielä saaneet omaa indeksiä tässä laskennassa. Näiden koirien BLUP-indekseille saadaan odotusarvo isän ja emän indeksien keskiarvoista.
Indeksien
laskennassa otetaan sukulaistietojen lisäksi huomioon kaikki koiran tulokseen
vaikuttavat ympäristö- ja muut tekijät, joista löytyy tieto aineistosta.
Periytymisasteiden ja indeksien laskentaa varten on tutkittava, mitkä tekijät
kullakin rodulla vaikuttavat, eli mitä tekijöitä tilastolliseen malliin on
sisällytettävä. Muita kuin tilastollisesti merkitseviä tekijöitä (p<0.05) ei
laskentamalleihin otettu. Kennelliiton tiedostot eivät tietenkään sisällä
tietoja yksittäisen koiran ruokinnasta tai liikunnasta, joten niitä ei pystytty
ottamaan huomioon laskennassa. Jonkin verran tällaisia ”hankalia” kasvuhäiriöihin vaikuttavia
ympäristötekijöitä pystytään huomioimaan sukulaistietojen avulla.
Indekseissä on siis otettu huomioon ne koiran tulokseen vaikuttavat
tekijät, jotka mallissa ovat mukana (Taulukko 1). Näiden tekijöiden vaikutus on
poistettu koiran tuloksesta jotta saataisiin koiran perinnöllinen taso esille.
Kasvattajatekijä tarkoittaa koiran
kasvattajan vaikutusta pentueeseen ruokinnan, hoidon ja erilaisten
ympäristötekijöiden kautta. Pentue kuvaa kaikkia samalle pentueelle yhteisiä
tekijöitä, mm. joitakin täyssisaruksille yhteisiä geenivaikutuksia, pentuekokoa
sekä emän ja kasvattajan vaikutusta pentuihin ennen ja jälkeen pentujen
syntymän. Kuvaaja on röntgenkuvan ottanut eläinlääkäri, arvostelija Suomen
Kennelliiton lonkka- tai kyynärlausunnon antaja. Emän ikä tarkoittaa emän ikää
tämän tietyn pennun/pentueen syntyessä. Syntymävuosi-kuukausi on
syntymävuodesta ja -kuukaudesta tehty ns. yhdystekijä.
Taulukko 1. Lonkka- ja kyynärdysplasiaan vaikuttavat tekijät, jotka otettiin huomioon periytymisasteiden ja BLUP-indeksien laskennassa
Tekijä |
Suomenajokoira |
Kultainennoutaja |
Rottweiler |
||
|
lonkat |
lonkat |
kyynärpäät |
lonkat |
kyynärpäät |
|
|
kasvattaja |
x |
x |
x |
x |
x |
|
pentue |
x |
x |
x |
x |
x |
|
kuvaaja |
x |
x |
|
x |
|
|
arvostelija |
|
x |
|
|
x |
|
koiran ikä |
|
x |
|
x |
x |
|
emän ikä |
|
|
|
|
|
|
pentuekoko |
|
|
|
|
|
|
sukupuoli |
x |
x |
x |
x |
x |
|
syntymävuosi |
|
x |
|
|
x |
|
syntymäkk |
|
|
x |
|
x |
|
synt.vuodenaika |
|
x |
|
|
|
|
synt.vuosi-kk |
x |
|
|
x |
|
Periytymisaste (h2)
kertoo missä määrin geenit keskimäärin vaikuttavat kunkin koiran tulokseen ja
toisaalta kuinka suuri osuus koirien välisistä eroista nivelten rakenteessa on
geeneistä johtuvaa. Jos koiralla on ominaisuudesta vain yksi tulos (niinkuin
dysplasiassa usein on), voidaan koiran jalostusarvoa ominaisuuden suhteen
ennustaa fenotyyppituloksen perusteella varmuudella Öh2.
Lonkka- ja kyynärdysplasian periytymisasteet olivat alustavien analyysien
mukaan vähintään kohtalaisia, ja korkein periytymisaste oli suomenajokoirien
lonkkadysplasialla (Taulukko 2). Rottweilereiden lonkkadysplasian
periytymisaste oli tässä suuremmassa aineistossa jopa 20 prosenttiyksikköä pienempi
kuin vuonna 1998 laskettu periytymisaste (0.58 -> 0.38). Aineistoa oli
tullut niin paljon lisää, että muutos ei ole kovin hämmästyttävä - pikemminkin
rottweilereiden periytymisaste on nyt ”normaalilla” tasolla. Lonkkadysplasiasta
poiketen kyynärdysplasian periytymisaste oli rottweilereilla noussut
edellisestä laskennasta neljä prosenttiyksikköä.
Periytymisasteen ollessa pieni
(pienempi kuin 0.10 eli 10%), koiran oma tulos on epävarma ennuste koiran
jalostusarvosta. Tällöin jalostusvalinnassa on kiinnitettävä huomiota
enemmänkin koiran jälkeläisiin. Jos periytymisaste on suuri (yli 40%), on
omakin tulos hyvä ennuste koiran jalostusarvosta. Periytymisasteen suuruus
vaikuttaa myös indeksin tietolähteiden painotuksiin, ja siksi periytymisaste
tulisi tarkastaa säännöllisesti aineiston muuttuessa, jos aineisto ei jo
alunperin ole hyvin suuri. Kun periytymisaste on pieni, indeksissä painotetaan
enemmän jälkeläisten ja sukulaisten tuloksia. Kun periytymisaste on suuri,
koiran oma tulos saa suuremman painon.
Kasvattaja ja pentue vaikuttivat
lonkkiin eniten kultaisellanoutajalla; niiden vaikutusosuus lonkkien laadusta
oli tällä rodulla keskimäärin kuusi ja viisi prosenttia (Taulukko 2). Toisin
sanoen kasvattaja ja pentue olivat ”vastuussa” keskimäärin kuuden ja viiden
prosentin osuuksista koiran tuloksessa.
|
|
Suomenajokoira |
Kultainennoutaja |
Rottweiler |
||
|
|
lonkat |
lonkat |
kyynärpäät |
lonkat |
kyynärpäät |
Havaintojen lkm |
1855 |
8210 |
2422 |
4230 |
3222 |
Periytymisaste |
0.42 |
0.27 |
0.25 |
0.38 |
0.35 |
|
Kasvattaja |
0.04 |
0.06 |
0.03 |
0.05 |
0.01 |
|
Pentue |
0.03 |
0.05 |
0.05 |
0.03 |
0.04 |
Koska
periytymisasteet olivat kaikissa roduissa vähintään kohtalaisia, ovat lonkka-
ja kyynärnivelen kasvuhäiriöt hyvin vähennettävissä jalostusvalinnan avulla.
Suuri periytymisaste tarkoittaa myös sitä, että populaatiosta (rodusta) löytyy
paljon perinnöllistä vaihtelua (erilaisia geenejä) joista voidaan valita
”parhaat päältä”. Jos ja kun indeksien käyttö yleistyy, voitaisiin
rotujärjestöjen niin halutessa korvata PEVISA:n nykyiset koiran omaan tulokseen
perustuvat rajoitukset indeksirajoituksilla. Näin valinta kasvuhäiriöiden
vähentämiseksi perustuisi koiran geneettiseen arvoon sen ilmiasun sijasta.
Mäki, K. 1998.
Tutkimus Suomen Rottweilerpopulaatiosta: Dysplasiat ovat selvästi periytyviä.
Koiramme 10/98.
Mäki, K. 1999 ja
2000. Koirien lonkka- ja kyynärniveldysplasian vähentäminen jalostuksen avulla:
Tutkimussuunnitelma. Golden Ring 3/99 ja Ajokoiramies 1/2000.
Mäki, K. 2000.
Sukulaisuussuhteesta sukusiitokseen. Golden Ring 3/2000.